1、微電子工業

　　微電子工業是當前對潔淨室要求高的行業。大規模和超大規模集成電路（LSI、VLS1）的發展，對微塵控製要求越來越高。集成電路製造工藝中，集成度越大，圖形尺寸（以線寬為代表）越細，對潔淨室控製粒徑的尺寸也要求越小（通常為線寬的1/10），且含塵量也要求越低。此外，現代工業中的液晶、光纖等的生產，同樣有潔淨度的要求。潔淨無塵車間

　　2、醫療工業

　　藥品生產

　　我國的《藥品生產管理規範》（又稱GMP）已在全國範圍內實施，對相應工藝過程及生產環境提出了不同潔淨級別的要求。對於原料藥製備、粉劑、針劑、片劑、大輸液的生產、灌裝等工藝，均已製定了潔淨區和控製區的潔淨標準。除了限定空氣中塵埃粒子的大小和含量外，對生物粒子（細菌數）也有明確的限製。

　　醫院

　　白血病的治療室、燒傷病房、外科手術室，也需要根據具體條件采用空氣潔淨工程，以防止空氣中細菌感染，對治療環境起到控製作用。

    3、食品工業

　　食品工業中使用潔淨技術較有代表性的是無菌裝罐。食品的無菌包裝（如軟包裝鮮果汁、牛乳等），在保持食品色、香、味、營養等方麵大大優於高溫殺菌的罐裝食品。所謂無菌包裝，就是在潔淨環境中完成包裝工藝。除無菌罐裝外，空氣潔淨工程在食品的釀造、發酵中對純種的培養、分離、接種、擴種以防止菌體等汙染及提高產品質量也有重要作用。潔淨無塵車間

　　4、生物安全

　　在遺傳工程、藥品及病理檢驗、生物分子學、國防科研等方麵常常需要在無菌無塵的環境中進行操作，一方麵要要求試件不受其他微生物汙染，另一方麵又要求所研究的材料，如腫瘤病毒、高危險度病原菌、放射性物質等不致外溢，危害操作者的健康及汙染環境。對於這類實驗操作，一般要求兩級隔離，1級常用生物安全工作櫃使工作人員與病原體等危險試件隔離；2級是將實驗工作區與其他環境隔離。這類實驗室與一般潔淨室不同，其處於負壓狀態。

　　5、實驗動物飼養

　　為了保證醫藥品、食品長期試驗的安全性，以及病理等方麵研究結果的可靠性，要求實驗動物在潔淨環境中飼育。從控製微生物的角度出發，可將醫學及生物學等實驗所用的實驗動物飼育環境分為三類：隔離係統、半隔離係統和開放係統。前兩類係統所飼養動物要求無菌（包括細菌、病毒寄生蟲等），或者僅允許帶有已知的幾種微生物，或者不允許帶有某些特定的致病菌等。潔淨無塵車間